Origine et histoire
L'ancienne église paroissiale Saint-Jean-Baptiste de Baume-les-Messieurs se situe à La Peyrouse, hameau proche de l'abbaye, à l'entrée de la reculée de Baume-les-Messieurs, un site géologique caractéristique du Jura. Les archéologues ont repéré sur l'emplacement de l'église et du cimetière des vestiges d'une construction gallo-romaine, ce qui suggère une continuité d'occupation du site depuis la fin de l'Antiquité. L'église est attestée par une bulle de 1089 qui confirme sa possession par l'abbaye, mais rien de précis n'est connu sur les édifices médiévaux qui s'y sont succédé. Les trois niveaux inférieurs du clocher-porche remontent à une campagne de construction du XVIe siècle. La première moitié du XVIIIe siècle a vu une reconstruction importante : la nef a été refaite peu avant 1739, puis le reste de l'édifice a été reconstruit avec quelques différences de structure. Au milieu du XVIIIe siècle, deux chapelles latérales ont été adossées symétriquement à la travée du chœur, formant un faux-transept, et le clocher a été surélevé d'un étage en 1770. La voûte de la chapelle latérale sud a été reconstruite en 1895. Malgré ces campagnes successives, l'église conserve une unité d'aspect tant à l'extérieur qu'à l'intérieur. L'édifice est précédé d'un clocher-porche ; le toit à deux pans couvre également les chapelles latérales et présente des laves qui s'accordent aux falaises voisines. On remarque une porte de porche moulurée et une porte latérale encadrée de pilastres ioniques. L'intérieur se compose d'un seul vaisseau voûté d'arêtes, les voûtes s'appuyant sur des pilastres toscans. Le chœur conserve un rétable et des lambris intégrant des toiles peintes, tandis que la nef abrite de nombreuses pierres tombales. Cette petite église bénéficie d'une situation exceptionnelle, et le site a été inscrit en 1964.