La bastide de Lamontjoie de Saint-Louis est fondée en 1298 par le sénéchal d'Agenais. Philippe le Bel confirme l'acte de fondation de la bastide l'année suivante. La tradition veut qu'il ait offert les reliques de Saint Louis à la bastide. Le seigneur de Lamontjoie était le roi de France.
La première église Saint-Louis date de cette époque. Il en subsiste des éléments dans le mur nord de l'église.
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