Origine et histoire
Les premières pièces proviennent de curiosités rassemblées au XVIIe siècle par les frères Gaspard de Liergues et Balthasar de Monconys. Au XVIIIe siècle, Jérôme-Jean Pestalozzi, médecin à l'Hôtel-Dieu, acquiert et enrichit cette collection, qu'il transmet ensuite à son fils Antoine-Joseph, lequel la cède à la Ville de Lyon contre une rente viagère. Placées sous la garde de l'Académie des Sciences, des Belles-Lettres et des Arts de Lyon, ces collections rejoignent la bibliothèque, le médailler et la collection d'histoire naturelle de Pierre Adamoli dans un pavillon de l'Hôtel de Ville et le musée ouvre au public en 1777, la ville retenant comme date de fondation le 1er janvier 1772, moment de l'ajout des collections Monconys-Pestalozzi aux biens d'Adamoli. À partir de 1793, les collections sont transférées au couvent des Dames-de-Saint-Pierre où elles sont abandonnées et pillées pendant la Révolution ; pendant des décennies elles sont déplacées entre les Terreaux et la Croix‑Rousse et subissent destructions et pertes. Entre 1830 et 1909, le muséum connaît un fort développement et accumule un patrimoine remarquable, tout en partageant les locaux du Palais Saint-Pierre avec le musée des Beaux-Arts, situation devenue rapidement insatisfaisante. En 1876 Émile Guimet entreprend une mission en Orient ; en 1879 il fait don à Lyon d'un musée des religions, logé dans un bâtiment néoclassique dessiné par l'architecte Chatron boulevard des Belges, avant que ses collections ne soient finalement transférées à Paris. Le bâtiment lyonnais connaît plusieurs réaffectations (brasserie, salles de sport, théâtre, patinoire) puis retrouve en 1913 sa fonction muséale en accueillant un musée des religions et le muséum d'histoire naturelle, réunissant objets historiques et collections de sciences naturelles (grands mammifères, insectes, minéraux, fossiles). En 1991 l'exploitation du musée Guimet est confiée au Conseil général du Rhône et il devient muséum d'histoire naturelle ; l'état du bâtiment et les besoins de conservation conduisent à initier un projet de transformation profonde. Adopté en 2000, le nouveau projet culturel et scientifique définit les orientations du futur musée des Confluences, s'appuyant sur les collections existantes — plus de 2,2 millions d'objets rassemblés du XVIIe au XXIe siècle — et visant à élargir la programmation culturelle et scientifique.
