Origine et histoire
Henri Dupuis (1819-1889) constitue au cours de sa vie une vaste collection d'histoire naturelle, d'arts décoratifs et de peintures qu'il installe progressivement chez lui en transformant une grande partie de sa maison en musée. Il crée notamment deux grandes galeries tapissées de vitrines pour exposer ses céramiques et ses coquillages. À sa mort en 1889, il lègue sa demeure et l'ensemble de ses collections à la Ville afin qu'elles soient présentées au public, « utile à tous, surtout à la jeunesse », pour mieux faire connaître le patrimoine flamand et les naturalia. Le musée ouvre ses portes en 1894 et la société des Antiquaires de la Morinie assure des permanences pour son accueil, conservant la présentation conçue par Dupuis. La donation de Charles Van Kempen en 1921 enrichit les collections d'ornithologie avec plusieurs milliers de spécimens, et lors de la répartition des collections décidée en 1950, les collections d'histoire naturelle sont regroupées au musée Henri Dupuis tandis que les beaux-arts et arts décoratifs rejoignent le musée de l'hôtel Sandelin ; la cuisine flamande reste une exception. Dans les années 1970, des dioramas sont aménagés au rez-de-chaussée pour présenter plus réalistement une partie des oiseaux naturalisés, tandis que le bureau d'Henri Dupuis, la cuisine flamande et la salle des coquillages conservent leur présentation d'origine. Le musée ferme en 2004, le bâtiment n'étant plus conforme aux normes d'accueil, mais l'équipe des musées de Saint-Omer poursuit le travail de récolage, de restauration et de mise en valeur des collections. Pour permettre au public de profiter de ce travail, des projets et expositions sont organisés au musée Sandelin, lors des Journées européennes du patrimoine, de la Nuit européenne des musées ou hors-les-murs. En 2019, la ville et ses musées célèbrent le bicentenaire de la naissance d'Henri Dupuis par une exposition intitulée Henri Dupuis, deux cents ans de passion.