Origine et histoire
L'ancien couvent des Bénédictins, aujourd'hui hôtel de la préfecture du Jura, est situé à Lons-le-Saunier. Le noyau primitif comprend une église construite à la fin du XIe siècle sur une crypte datée de la première moitié du XIe siècle, avec des remplois qui pourraient remonter au VIIIe siècle. Le prieuré se constitue au XIIe siècle, puis le couvent et son cloître sont partiellement ruinés par des incendies signalés en 1636 et 1637. De 1711 à 1715, Dom Vincent Duchesne entreprend la reconstruction totale des bâtiments conventuels. Après la Révolution, le site est transformé en hôtel de préfecture et les constructions autour du cloître sont complétées ; Gabiot procède à des aménagements en 1809, entraînant notamment la démolition de deux chapelles et de deux travées de la nef. L’entrée principale a été aménagée au nord-est en 1809, tandis qu’un portail d’honneur à grille en fer forgé se situe au nord-ouest. À l’est, les locaux s’organisent autour d’une seconde cour créée en 1849, et un bâtiment destiné aux archives est élevé en 1895 ; des bâtiments administratifs supplémentaires sont adossés au cours du XIXe et du XXe siècle. Parmi les interventions successives figurent la reconstruction du clocher en 1604, son arasement en 1795, puis sa reconstruction par Achille Paillot en 1880, la construction d’un escalier extérieur et du portail nord de l’église par Pourchot en 1845, d’importants travaux de restauration et l’édification de deux chapelles au sud en 1852, l’ouverture du portail occidental en 1900 et la restauration de la crypte en 1935. Un réaménagement avec une entrée publique a été réalisé dans les années 1970. Dans l’aile sud, un grand escalier en pierre muni d’une rampe en fer forgé dessert les appartements d’honneur de la préfecture, qui conservent des décors. Dans une cave des anciens bâtiments conventuels se trouve un bassin maçonné dit « fontaine de Rome », dont l’origine pourrait remonter au haut Moyen Âge. L’édifice est partiellement inscrit au titre des monuments historiques depuis le 12 mai 1999.
