博物館の起源は、SNCFがChalon-sur-SaôneとSézanneの堆積物をグループ化することに決めた1961年に遡ります。 同じ年、Mulhouseの都市は、これらのコレクションをホストするためにドーナックで多くのことを提供しました。 1969年、"Association du musée français du Chemin de fer"が設立され、1971年、博物館は2人の愛好家のイニシアチブのおかげで扉を開けました:Mulhousian Industrialist Jean-Mathis Horrenbergerとパリの鉄道専門家Michel Doerr。 初期にシャロン・シュル・ソーンに保管された最初の機関車がMulhouseに移りました.
1976年(昭和27年)に開館し、新館に初出展しました。 1983年(昭和40年)に増築され、年間240,000人の来場者に出席しました。 トラフィックの減少に直面して、大手リフォームは2005年に発売され、同社のカルチャースペースに委託され、すでにCité de l'Automobileを管理しました。 州、アルザス地域、ハウト・ラン部、ムルハウス市が資金を積んだ€8.6百万の予算は、スペースを近代化することができます。 建築家François Seigneurは、没入感のある風景をデザインしています。Le siècle d'or du chemin de fer(1860-1940)は、6万m2のホールに104の客室を強調しています.
注目のアトラクションの中で、7 1/4インチのミニチュア列車は、2013年以来、博物館の周りを旅行することができます。 デポビル蒸気機関車、協会センター・デ・ラ鉱山et du chemin de fer d'Oigniesによって改装され、24人の乗客を牽引します。 「Ferrerie des amateurs de vapor」によるメンテナンスを実施 これらの要素は、没入型公共体験と伝統の保存を組み合わせることを目的とした博物館のコミットメントを示しています.